酒精不能外涂龟头，并且它不能外涂阴囊的皮肤和阴茎的皮肤，也不能用于眼部的皮肤进行消毒。因其具有强烈的刺激性，可致此部位的黏膜出现腐蚀性的糜烂、红肿、疼痛等，所以不能应用于此部位，但可应用于身体其他部位的常规消毒。
目前临床上已不常规使用酒精作为皮肤消毒剂，而使用亲肤质的碘伏溶液进行消毒，它可以应用于全身各个部位的皮肤和黏膜，不会造成皮肤和黏膜的损伤，也无需使用酒精进行脱碘治疗，不会造成碘液在皮肤上残留。
目前酒精已不能应用于临床上的消毒，而且建议使用其他的皮肤消毒溶液涂抹龟头，建议选择碘伏溶液涂抹龟头和阴囊等处的皮肤，来进行局部消毒处理。