小孩夜哭的原因可能有很多种，最常见的原因可能是由于缺乏维生素D、缺钙所导致的佝偻病。儿童患佝偻病的早期可以出现神经、精神症状，其主要表现为夜间睡眠不安、哭闹、多汗，也可以出现明显的易激惹现象。
另外部分孩子半夜哭闹存在有消化系统的疾病，由于消化不良引起的腹胀、腹痛，甚至是腹绞痛，这些情况可以导致夜间出现哭闹。还有部分宝宝可能是因为睡眠障碍性疾病，比如夜惊、梦魇等，这些睡眠障碍疾病的发生，可能与白天所经历的不良环境因素、特殊刺激以及宝宝焦虑的性格有关系。