流产后三个月再怀孕一般是允许的，不管是自然流产还是人工流产，流产对于子宫尤其是子宫内膜都有一定的损伤。建议流产恢复三次正常的月经周期后，再进行第二次的备孕，由于子宫内膜有损伤，需要一段时间的增生和修复，如果子宫内膜没有完全的修复就再次怀孕，有可能会增加再次自然流产或者胚胎停育、生化妊娠的风险。
如果在流产后三个月内发现怀孕，建议密切的观察胚胎发育情况，适当的给予黄体酮保胎，避免由于子宫内膜损伤或者厚度不够造成流产和胚胎停育。