引起口腔溃疡最主要的原因是患有口腔黏膜溃疡，溃疡患者可以局部用药以消炎止疼，促进溃疡愈合。可以选择的药物有西瓜霜喷剂、康复新液、抗生素软膏、利多卡因凝胶和重组人表皮生长因子凝胶等药物。
对于深大、长期不愈合的溃疡，患者需要在溃疡局部注射曲安奈德和利多卡因的混悬注射液。对于反复口腔溃疡的人群，需要补充维生素C、维生素B，以及微量元素铁、锌，并且患者要进食清淡、易消化的食物，应戒烟、戒酒。
另外，口内有残根、残冠、尖锐牙尖、不良修复体等因素时，导致患者相应的黏膜处出现溃疡、糜烂，这种情况下先要去除局部刺激因素，可以用消炎和止疼药膏防治感染、止疼。