疱疹治疗时抗病毒治疗是首选，阿昔洛韦软膏外用有帮助。如果伴有感染，碘伏、莫匹罗星乳膏外用有帮助。但是不同的疱疹治疗方案略有不同，严重的单纯外用药无法控制病情，轻症的可以自愈，或者单纯外用药即可。
但是像带状疱疹等一般症状较重，需要口服抗病毒药物，阿昔洛韦、伐昔洛韦等都可以，严重的需要输液治疗，同时配合氦氖激光等治疗，效果不错。
疾病的不同阶段用药也不一样，生殖器疱疹复发次数越多，症状越轻，治疗方面也越简单，一周左右缓解。正常的生活方式可以减少疱疹复发，适当的参加体育运动，加强营养支持，还要注意预防受凉、疲劳以及感染的情况。