目前巧囊没有一定不能吃的食物，但是要避免吃含有雌激素的食物，尤其是激素补充治疗的病人要慎重，因为卵巢的巧囊，也就是卵巢的子宫内膜异位囊肿是与激素分泌有关的，卵巢的巧克力囊肿属于女性的盆腔子宫内膜异位症的一种表现形式，往往还会合并有其它的子宫内膜异位症，比如子宫的腺肌症、盆腔内有深部结节，或者子宫骶骨韧带有触痛等等临床表现。
子宫内膜异位症是与卵巢分泌的雌激素有关的，根据卵巢的激素水平分泌出现规律的月经来潮，子宫内膜异位病灶也会呈现周期性的变化，就像来月经一样，每一次来月经，内膜异位病灶都会出现一次出血，因此对于巧克力囊肿，囊内的出血量就会逐渐的增多，就会导致卵巢的巧克力囊肿逐渐长大，这种现象甚至有可能会导致囊肿的破裂出血。
所以对于有巧克力囊肿的病人，雌激素的食物或者人为的补充雌激素要非常慎重。