如果早晨起来感觉肾区这个部位疼痛，不一定是肾脏有问题。当然建议还是医院就诊，先完善尿常规以及泌尿系彩超，主要是除外有没有泌尿系统疾病，如泌尿系统的结石等相关的情况。还有就是要除外泌尿系感染，这些泌尿系统疾病可能会引起肾区的疼痛。
但是，引起肾区疼痛的原因并不仅仅只有泌尿系统疾病的问题。如果以上检查都没有问题，还要看一下有没有局部的神经、肌肉相关的疾病，包括腰肌劳损等情况。另外，还有一些病人是腰椎、腰肌出现了问题。所以如果出现腰疼、肾疼等情况，建议及时到医院就诊，明确诊断。