大约有95%的宫外孕都是输卵管妊娠，引起输卵管妊娠最常见的原因是输卵管炎症，无论是输卵管粘膜炎或者是输卵管周围炎，都有可能导致输卵管不通，会影响受精卵的运行，导致输卵管妊娠。
还有一种原因是输卵管发育不良，先天性输卵管发育不良有可能导致输卵管妊娠，宫内节育器的放置也是输卵管妊娠的一个主要原因。
曾经有过输卵管的妊娠史，再次怀孕后也有可能出现输卵管妊娠，辅助生殖技术也会导致输卵管妊娠。子宫肌瘤或者卵巢囊肿，任何会出现输卵管蠕动障碍的因素，都有可能导致输卵管妊娠。