脑炎确诊最可靠的依据是做腰椎穿刺术，也就是做脑脊液的检查。脑脊液检查可以明确是不是有脑炎，以及脑炎的性质是什么，因为引起脑炎的原因有很多，病毒、细菌、结核、真菌等多种病原体都可能会引起脑炎，所以脑脊液的检查是可以明确的。一旦明确了脑炎的病原菌，有针对性的治疗，可以及时治愈。还有一种方式是做磁共振检查，磁共振检查是一种辅助的检查方法，可以判断脑实质内有没有病灶。