三个月的婴儿如果医生要求做心脏彩超，主要有以下几种可能：
一、怀疑先天性心脏病：最大的可能是医生怀疑其患有先天性心脏病，因此要通过心脏彩超来判断有没有心脏结构方面的畸形。
二、评判心功能：通过心脏彩超测量左室的射血分数来进行评估。
三、排查心肌病：这种情况下，心脏彩超是很好的检查手段，能够看到心肌的问题。
四、其他的可能：医生要看一下孩子的冠状动脉起源有没有问题，如果是川崎病，冠状动脉有没有扩张。
总之，以上是三个月的孩子做彩超的几种原因。