小三阳和乙肝携带者，两者体内都携带了乙肝病毒，要判断哪个病情更严重，应该要参考以下两个检查，具体如下：
一、肝功能：如果肝功能出现了异常，表现为转氨酶或黄疸指标升高，数值越高，代表病情就越重。
二、肝脏彩超报告：如果肝彩超提示有回声不均匀，肝脏体积缩小，有结节形成时，要高度怀疑有肝硬化或者肝里面见到有异常的占位性结构，高度怀疑肝癌时，这个时候都提示病情偏重。
因此，小三阳和乙肝携带者，要判断哪个病情更严重，主要通过肝功能和肝彩超来加以判断。