在怀孕期间做亲子鉴定，主要是提取母体内胎儿的遗传基因与待鉴定的男性的遗传基因进行检测。妊娠期做亲子鉴定，提取胎儿遗传物质的方法，一个是抽取孕妇的静脉血，再一个就是抽取羊水。
抽取孕妇的静脉血是一种没有明显创伤性的检查方法，提取孕妇静脉血中孩子的DNA片段与疑似的父亲样本进行检测，就可以确定其亲缘关系。如果对这样的检查方法不放心，那么可以通过宫腔内穿刺抽取羊水的方法提取孩子的遗传物质，与待测的男性的样本进行检测，准确性更高。