黄芩性味苦寒，注入人体的肺经、大肠经和小肠经，主要作用是清热泻火，另外有解毒的功能，黄芩的作用在临床使用来讲：
第一、可以治疗肺热症状，比如风热犯肺引起的咳嗽、咯痰，痰的质地是黄痰，而且质地黏，难以咯出，肺热壅盛导致的喘证等都可以用黄芩来治疗。
第二、如果是肺热下移于大肠，导致肠道的湿热症状，引起的热力也就是大便次数增多，而且大便的味道臭秽吗，有里急后重的感觉，相当于现在的一些传染性痢疾的症状，中间都会用到黄芩。黄芩虽然说是清热解毒药，对上、中、下焦都有作用，但是相对来讲更偏重于上焦，解除肺系的湿热症状会更好一些。另外黄芩如果用于外用，和黄连、大黄等共同的研成粉末状敷于疮、痈、肿、毒，上面也有很好的清热解毒，促进创伤收口的作用。