肚子胀又伴有腹泻多数是因为肠道功能紊乱，引起消化不良造成的，可以服用健胃消食片、复方阿嗪米特、多酶片、蒙脱石散、黄连素片等。可以有效帮助恢复肠道的消化功能。
肠道菌群失调也会引起肚子胀、腹泻，可以先做肠镜检查，若肠道黏膜无异常现象，可口服三联活菌缓解肠道菌群失调的症状。如果胀气腹泻比较严重可以检查便常规和血常规，确诊是否有细菌感染，食用不洁食物后，肠道因细菌感染引起的渗透性腹泻，需要使用抗生素治疗，例如阿莫西林或者左氧氟沙星等。
患者在治疗期间需要注意清淡饮食，禁止食用生冷、刺激性食物。