碘伏不能治中耳炎，如果是急性中耳炎，病人有耳痛、耳流脓，甚至发烧，通常会给予抗生素进行滴耳。如果脓性分泌物比较多，可以用双氧水洗耳后用抗生素滴耳，可以口服抗生素，比如头孢、阿奇霉素类。
如果是分泌性中耳炎，通常会给予抗过敏药物口服，同时鼻腔给予鼻减充血剂治疗，比如麻黄素，一般用一周停止。如果分泌性中耳炎持续时间比较长，可以用耳膜穿刺、耳膜置管的方式将液体引流。如果慢性化脓性中耳炎，有鼓膜穿孔，炎症消失时可以行鼓膜修补术，如果伴有胆脂瘤，应行手术治疗。