肺叶部分切除后最大的后遗症是有效肺泡组织减少，导致的不同程度肺功能不全。患者可能会出现胸闷、气急，尤其是在活动的状态下，肺组织的膨胀面积减少，导致不同程度的胸闷、气急。如果正常情况下肺功能正常，术后通过营养支持、功能锻炼，被切除肺组织的部分功能，可以随着时间的推移，周围肺组织不断的增强，可以替代被切除部分肺组织的肺功能。
但是如果已经有部分的肺功能不全，加上营养跟不上、功能锻炼也不够，肺叶切除后的有效肺泡组织减少，导致的肺功能障碍就会进一步加重。因此同样是肺叶部分切除，每一个人的后遗症，对肺功能影响的严重程度，甚至波及到肺动脉高压、心脏的严重程度，依据每个患者本身的心肺功能、营养状况、功能锻炼等，可以完全不一样。有的患者可以完全恢复正常，有的患者就可能出现不同程度的呼吸功能不全，甚至可以导致心功能不全。