急性肾盂肾炎需要与以下几种疾病进行鉴别诊断：
1、下尿路感染，急性肾盂肾炎属于上尿路感染，而下尿路感染主要以膀胱刺激症状为主，如尿频、尿急、尿痛，全身的中毒症状通常较轻。
2、与肾结核鉴别诊断，肾结核的患者也可出现畏寒、发热以及膀胱刺激症状。但肾结核的患者经过抗生素治疗后无明显的效果，此时需要完善尿结核抗体培养，可发现肾结核。
3、其他全身性的感染性疾病，由于急性肾盂肾炎常可以全身中毒症状为主，而局部的泌尿系统感染症状常较轻。所以，需要与其他系统感染做鉴别诊断，如呼吸道感染、皮肤感染、肠道感染等。