干扰素，是目前临床常用的治疗急、慢性病毒感染，或复发性病毒感染的药物。可以用于治疗，皮肤的疱疹病毒感染后出现的带状疱疹，或妇科泌尿生殖系统感染的尖锐湿疣、扁平疣，以及急、慢性的病毒性肝炎。
干扰素的副作用，最常见的是胃肠道的不良反应，比如恶心、呕吐、食欲不振，这些副作用是比较轻的。比较严重的副作用，会影响到造血系统的功能。可能会出现白细胞减少、贫血、血小板减低，或引起凝血功能障碍，导致出血风险增加。
长期使用干扰素，有可能出现肝功能的损伤，引起转氨酶一过性的升高。干扰素如果长期使用，有可能会诱发一些中枢神经系统的疾病，如癫痫。还可能导致中枢体温调节机制障碍，引起发热。