跑步时膝盖后侧疼痛，一般骨性关节炎的可能性最大。因为骨关节炎会出现腘窝囊肿，所以腘窝囊肿达到一定程度时膝盖后侧疼痛会加重。如果出现运动后膝盖后侧疼痛时要及时就医，通过影像检查确诊骨性关节炎的严重程度。
如果是轻微的骨性关节炎，通过药物和理疗等手段促使炎症消退。如果关节软骨受到破坏，关节面损伤比较重，建议跑步要减少，以减少对膝关节的磨损，否则骨性关节炎会加重而影响以后的生活。