CT检查是利用放射线对人体进行扫查，所以会对人体产生一定的辐射，辐射的剂量根据检查的部位不同，检查的方式不同，都会有所差异。其中CT平扫的辐射相对于CT增强检查，辐射剂量更低。而CT平扫当中，头部CT平扫检查剂量比其他部位的更低。
但无论是哪一个部位的CT检查，无论做的是哪一种方式，只要是在医学检查的范围之内，对身体辐射量都低于国家规定的标准值，所以不会对人体产生明显的危害。在进行CT检查的时候，医生也会为患者遮挡住检查部位以外的部位。