引起宝宝奶癣的病因往往是复杂的，其发病与多种内外因素有关，有时很难明确具体的病因。例如过敏反应、机械性刺激、母亲的遗传因素等，都有可能导致宝宝患有奶癣。
一、主要病因
1、患儿往往由消化道摄入食物性变应原，如鱼、虾、牛羊肉、鸡蛋等致敏因素。奶癣的高发病率主要是由于患儿皮肤角质层薄，毛细血管网丰富，以及内皮含水及氯化物较多，因而容易发生变态反应。
2、机械性摩擦如唾液和溢奶经常刺激，也是本病的诱因。护理不当，如过多使用较强的碱性肥皂、过高营养，以及肠内异常发酵等也可引起本病。
3、有些婴儿有遗传过敏素质(异位性素质)，家族中也有异位性皮炎、鱼鳞病、哮喘或过敏性鼻炎等病史，患儿对食物过敏，血中IgE数值增高，嗜酸细胞增高。随着年龄增长，皮肤损害逐渐限局于四肢屈侧处(肘窝、腘窝)，往往剧烈抓痒、反复不愈，直至儿童期甚至延续到成人期。
4、某些外在因素如日光、紫外线、寒冷、湿热等物理因素，接触丝织品或人造纤维，外用药物以及皮肤细菌感染等，均可引起奶癣或加重其病情。
二、诱发因素
1、食物因素：富含蛋白质的食物，鱼、虾、蛋类及牛乳等，婴儿接触后发生过敏反应。 
2、外部刺激：毛制品、植物(各种植物花粉)、化学物品(护肤品、洗浴用品等)、化纤物品、动物皮革及羽毛等物品的刺激。
3、病理因素：病毒或细菌感染、蛲虫。
4、环境因素：日光照射、高温或寒冷、穿衣不当等的刺激都可能会诱发此病。