眼药水一般都是用来治疗眼睛疾病的，抗病毒的眼药水如阿昔洛韦滴眼液对病毒性角膜炎、病毒性结膜炎有治疗效果，抗细菌眼药水如妥布霉素滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液，可以对细菌性结膜炎或角膜炎进行治疗，对感染性眼内炎也有治疗效果。抗过敏的眼药水如富马酸依美斯汀滴眼液、帕坦洛滴眼液，对过敏性结膜炎有治疗效果。也有补充泪液的眼药水，对干眼症、泪液分泌不足有治疗作用，如玻璃酸钠滴眼液、泪然滴眼液。也有免疫方面的眼药水，如含糖皮质激素类药物的妥布霉素地塞米松滴眼液，有抗青光眼作用的降压药物如马来酸噻吗洛尔滴眼液、派立明（布林佐胺滴眼液）。