Rathke囊肿和垂体瘤是蝶鞍区两种较为常见的病变，两者的区别如下：
第一、两者的发病机制不一样，Rathke囊肿是一种先天性疾病，是由于胚胎发育的时候，Rathke囊没有完全闭合所导致。而垂体瘤是后天形成，是由于正常的垂体细胞突变成肿瘤细胞，细胞生长不受控制，形成垂体瘤。
第二、两者的临床表现不太一样，Rathke囊肿绝大部分情况下没有任何症状，只有当囊肿体积较大时，会出现头痛、视力下降、垂体功能低下等表现。垂体瘤可能会出现明显的内分泌紊乱症状，还会出现视力下降等症状。
第三、两者的影像学表现不一样，Rathke囊肿在核磁共振上会表现为囊性病变，垂体瘤一般会表现为实质性病变，Rathke囊肿在增强核磁共振上没有强化，垂体瘤会有明显的强化。