慢性胃炎的病因包括以下几点：
一、幽门螺杆菌感染，幽门螺杆菌经口进入胃内，一部分可被胃酸杀灭，另一部分则附着于胃窦部黏液层，依靠其鞭毛穿过黏液层，定居于黏液层与胃窦黏膜上皮细胞表面。凭借其产生的氨及空泡毒素，导致细胞损伤，促进上皮细胞释放炎症介质，菌体细胞壁抗原引起自身免疫反应，多种机制使炎症反应迁延或加重，其对胃黏膜炎症发展的转归，取决于幽门螺杆菌毒株、独立宿主个体差异，还有胃内微生态环境等多因素的综合结果。
二、十二指肠胃反流、胃肠的慢性炎症、消化吸收不良及动力异常等所致，长期反流可导致胃黏膜慢性炎症。
三、自身免疫，胃底腺壁细胞除分泌盐酸外，还分泌一种黏蛋白称为内因子，它能与食物中的维生素B12结合形成复合物，使之不被酶消化，到达回肠后维生素B12得以吸收。当体内出现针对壁细胞或内因子的自身抗体时，自身免疫性的炎症反应导致壁细胞总数减少、泌酸腺萎缩、胃酸分泌降低，而内因子减少可导致维生素B12吸收不良，出现巨幼红细胞性贫血，称之为恶性贫血。
四、年龄因素和胃黏膜营养因子缺乏，老年人的胃黏膜常见黏膜小血管扭曲、小动脉壁玻璃样变性、管腔狭窄，这种胃局部血管因素可使黏膜营养不良、分泌功能下降和屏障功能降低，可视为老年人胃黏膜退行性改变。