病毒感染后发烧是因为病毒侵入体内以后，造成孩子免疫系统出现反应，会快速的增加体温调定点，体温就开始升高。在发烧的同时孩子的免疫系统也开始活跃起来，吞噬细胞和白细胞都会表现明显的活跃，同时对侵入的病毒也有抑制作用，抑制复制和活性，对于孩子的病毒感染会有自动的免疫抑制。
有些孩子的病毒感染如果是轻症的病毒，可能通过发烧的过程就达到自限的过程，并不是所有的病毒都能得到自限，有些比较强的病毒可能就会打破平衡，造成孩子机体出现严重的损伤。在孩子出现病毒感染、发烧，要体温进行控制，可以适当的使用物理降温或是药物降温，避免高热造成损伤，同时对孩子引发的临床症状进行适当处理，对症进行治疗，有些病毒也需要针对病毒进行控制，才能达到控制感染和缓解孩子发热的目的。