男性如果出现射精后疼痛的症状，一般是由于精囊或者是输精管道的病变所引起，比如精囊炎、射精管狭窄、精囊结核、精囊结石、精囊囊肿、精囊肿瘤等疾病。其中最常见的引起射精疼痛的原因是精囊炎，包括急性精囊炎和慢性精囊炎。
急性精囊炎的症状主要表现为尿频、尿急、尿痛，以及会阴部疼痛和不适，同时伴有射精疼痛、血精的症状，严重的时候会出现全身症状，比如发热、寒战、乏力等。如果是慢性精囊炎，主要的症状是血精、尿频、尿急、尿痛等下尿路症状。另外，精囊周围的一些病变，比如前列腺炎、前列腺结石、附睾炎、尿道狭窄等疾病，也会引起射精疼痛的症状。