绝大多数情况下，儿童发生手足口病以后，不服药很难自我痊愈。由于儿童发生手足口病是由于感染肠道病毒引起，无论儿童感染EV71肠道病毒还是柯萨奇肠道病毒，均会引起儿童出现手、足、口及臀部疱疹，从而引起手足口病。
如果儿童的手足口病属于普通型，没有高热持续不退及心肌炎、脑炎等并发症，此时只需要服用清热解毒的中成药即可，比如莲花清瘟胶囊等。如果手足口病的症状非常重，还需要及时应用甘露醇等降颅内压的药物。
无论儿童的手足口病是轻症还是重症，绝大多数需要用药物干预治疗，否则较难痊愈。