胆总管下段结石比较危险，因为胆总管下段结石容易引起症状发作，比较轻微的症状可能是闷痛不适，因为结石嵌顿引起胆汁排出不畅，从而导致相应的症状。如果是比较严重的症状，包括严重的胆道梗阻，出现急性胆管炎、腹痛、黄疸、高热，甚至梗阻进一步加重、胆管内压力升高、胆汁反流，会引起感染性休克、神经中枢的抑制，以及急性梗阻性化脓性胆管炎的风险。
如果梗阻到胆总管下端胰管的出口，也有可能导致急性胰腺炎、胆源性胰腺炎，胰腺炎也是比较危险的疾病。所以，胆总管下段结石建议尽早、尽快给予处理，考虑的不是结石本身的风险问题，而是结石引起的相关并发症，并发症的风险比较大。