临床上对于检查发现双侧肾脏有小结石，有可能是人体的代谢因素出现异常，包括胱氨酸结石或者尿酸盐结石。患者应该根据影像学检查判断结石密度，同时应该根据结石的成分分析，再进行治疗和饮食方面的预防。还有的因素是由于人体某些疾病导致，比如甲状旁腺功能亢进，导致人体血钙升高，从而在泌尿系统就会形成双侧的肾脏微小结石的情况，患者需要进行内分泌系统的检查，来明确这种疾病存在。还有的因素是长期慢性的泌尿系统感染，比如有泌尿系统梗阻，包括尿道狭窄以及老年男性前列腺增生，或者有神经性膀胱，导致尿液潴留，引起双侧尿路积水，继发双侧泌尿系感染，会导致双肾小结石。这种情况都是由基础疾病，患者进行判断和治疗比较容易，因此进行病因学方面治疗，可以解除疾病的进展。