硫糖铝片的副作用是导致便秘，并伴有口干，少见或偶见的不良反应有腰痛、消化不良、腹泻、瘙痒、皮疹、失眠、胃痉挛、嗜睡及低磷血症。而且有3%患者服用硫糖铝后，会出现轻度或者中度的便秘，也是由于硫糖铝直接作用于肠道，抑制肠道蠕动，并把肠道里的水分吸收导致。
使用硫糖铝片不能超过七天，长期服用会造成体液中磷缺乏，因此有甲状腺功能疾病、佝偻病、低血糖的病人不宜长期服用。如果症状没有得到缓解，就得赶紧去医院就诊，不过硫糖铝的副作用一般不影响其他治疗，具体的情况咨询医师，并按照医师指导服用就可以。