女性感染HPV病毒以后，大多是可以被自然清除掉，最短的时间是4-5个月可以被自然清除掉，最长的需要8-24个月才能被自然清除掉。但是也有少数的HPV高危型病毒，在女性体内可以长期存在，从而会导致宫颈的病变甚至于宫颈癌。
女性一生当中大概有70%的人曾经感染过HPV，但是大部分妇女可以通过自身免疫力把病毒清除掉，只有不到1%的最终可能发展成为宫颈癌。免疫清除病毒的能力主要取决于患者的年龄，21-25岁的女性体内的HPV病毒大多是一过性感染，大于30岁的女性，HPV病毒随着年龄增大清除率降低。绝大多数HPV感染都是一过性感染，并且没有临床症状。低危型HPV感染4-5个月消退，高危型HPV消退需要8-24个月。也有极个别的HPV感染不能被人体清除掉，持续存在就有可能会导致宫颈的高度鳞状上皮内病变或者宫颈癌。