精子染色体异常一般分为两种情况：第一种情况是染色体的数目异常；第二种情况是染色体的结构异常。无论哪一种情况，都有可能对精子的功能产生明显的影响，造成男性不育配偶不能够怀孕，即使能够怀孕，胎儿的生长发育质量也是不能够得到保证的。
出现精子染色体异常，建议到当地正规医院进行详细的检查，明确诊断，然后进行针对性的处理。处理的措施主要包括相应的药物治疗以及内分泌治疗等等，可以服用一些对泌尿生殖健康持保健作用的中成药物，如复方玄驹胶囊、五子衍宗丸、麒麟丸等等。还要针对不同的外界病因进行处理，比如针对前列腺炎的患者，可以进行相应的理疗、针灸、坐浴、药物等等。