支原体肺炎用阿奇霉素通常先用三天来观察一下疗效，如果发热、咳嗽的症状明显减轻，可以继续用5-7天，然后停用3天，需要再继续治疗，重新再用第二轮。
支原体肺炎是一种常见的社区获得性肺炎，阿奇霉素作为大环内酯类抗生素，对支原体有一定效果。如果阿奇霉素使用之后发热、咳嗽等症状没有明显的好转，有可能是阿奇霉素耐药，需要更换其它的抗支原体类药物，比如18岁以上的可以换新喹诺酮类药物，18岁以下的没有其它可以用的药物，只能再继续使用阿奇霉素来观察效果。因此阿奇霉素在治疗支原体肺炎的时候要观察效果，然后判断是继续用还是换药。
与红霉素和其它大环内酯类一样，其有严重的过敏反应报告，如血管性水肿和过敏症，有些因阿奇霉素引起的反应可反复发作，需较长时间的观察和治疗。由于肝脏是阿奇霉素清除的主要途径，故阿奇霉素用于明显肝病患者时应慎重。