核酸检测如果是指新型冠状病毒核酸检测，肯定查不出乙肝阳性。在实验室中检测不同的病毒或细菌，需要用不同的试剂，以及采用不同的方法进行试验，一般只针对一种病原微生物。
新型冠状病毒核酸检测只能检测出是否含有冠状病毒的核酸，不会对乙肝病毒的核酸进行检测，当然查不出有乙肝。另外两种检测方法也不同，冠状病毒核酸检测，只采集患者的鼻咽拭子。乙肝病毒主要存在于血液中，检查需要采集静脉血进行核酸或者抗体的筛查，乙肝病毒在鼻咽部也检测不到病毒，所以只采集鼻咽拭子纸肯定查不出有乙肝。