甲状腺球蛋白抗体升高，要考虑是自身免疫性甲状腺炎所致，这种疾病早期以原发病治疗为主，晚期则主要是做好对症治疗。如果发现的早，可以试用强的松等糖皮质激素治疗，必要时可以考虑用环磷酰胺等免疫抑制剂治疗，疗程一般需要数月、数年，病变有逆转的可能。
自身免疫性甲状腺炎早期，还可以有心慌、多汗等甲亢的表现，症状比较严重时，可以试用倍他乐克等药物做对症治疗。自身免疫性甲状腺炎到了晚期，会因为甲状腺细胞的损伤，出现心动过缓等甲状腺功能减退的表现。出现甲减症状后，需要用甲状腺素片等药物做替代治疗，甲减的治疗多需要终身用药。