正骨枪的危害主要在于是固定工具，并不能代替理疗师的手法和力度，灵活性比较差，所以有的时候过度会造成伤害，过小会达不到正骨的效果，主要是靠电能转换机械可以减轻正骨体力者的消耗，可以通过适当调节力度大小和震动频率，来进行相关的治疗，这种情况建议有经验的医生或者技师可以使用。如果没有经验或者经验不足，建议慎重使用，当造成不良后果的时候没有挽回的余地。
另外，除了正骨之外，患者还要平时注意避免受伤的动作、避免诱发的动作，比如久坐不活动或者弯腰、重物过多，这种情况也要注意，应该加强自我的功能锻炼，包括小燕飞、平板支撑等腰背肌的功能锻炼，还有四肢的活动，比如慢跑或者太极等柔软动作，对身体也非常有保健意义。