儿童牙齿涂氟的坏处为如果出现儿童误服，会有发生氟斑牙的风险，但是这种情况临床并不常见。而且少量的涂氟即使吞服，造成氟斑牙的几率也非常小，但涂氟对于牙齿预防龋齿有很明显的作用，而且对早期龋坏、没有出现明显牙体缺损的进行涂氟还会发生牙齿再矿化，从而终止龋病的继续发展，所以儿童牙齿涂氟坏处为存在导致氟斑牙的风险，但好处更多，对于预防龋齿有非常明显的作用。