小儿脑积水的治疗，一般需要手术治疗，药物治疗只是能够缓解症状。对于急性期梗阻性的脑积水，可以利用利尿剂和甘露醇来缓解症状。症状严重的可以考虑侧脑室外引流术，将脑脊液引流出体外。侧脑室外引流术作为紧急减压的抢救措施，可以快速缓解症状，为下一步治疗创造条件。
在紧急情况下可以反复多次腰椎穿刺，引流脑脊液，对脑室内出血或者是感染等因素引起的急性脑积水，也有一定的疗效。药物治疗主要是缓解症状，常用的临床药物，例如呋塞米是利尿剂，还有甘露醇是渗透性降颅压的药物。手术治疗一般可以采用脑室分流，或者是脑室镜下第三脑室底部造瘘术。