对于脑干出血的预后，跟脑干出血的位置、出血量有直接的相关性。脑干包括脑桥、中脑和延髓，中脑在最上，延髓在最下，脑桥位于中间。对于脑干出血预后相对比较好的为脑桥，如果出血量在5mL以下，一般预后比较良好。
脑干出血最凶险的属于延髓，延髓是属于生命中枢，当延髓出血的时候，病人可以出现呼吸、心跳骤停的风险，所以脑干出血位置很重要，一般脑干出血大于5mL，患者的预后非常不好。对于中脑出血病人严重时，可以出现意识丧失。对于脑干出血，主要根据出血量和出血部位评估预后。