临床上以下病症表现的患者都需要进行胃肠镜检查的，消化道占位性病变，如胃泌素瘤、十二指肠溃疡息肉、直肠细胞癌等。因为人体发生消化道占位性病变后，需要通过胃镜检查对病变组织进行活体取样检测，并通过病理学分析方式，对病症患者的病症类型、病理分期、肿瘤性质等疾病情况进行明确诊断。
不明性慢性腹泻，对于非炎症性疾病所引起的慢性腹泻症状患者，需要通过胃肠镜检查的方式，对消化器官内部组织进行侵入式检查，以确诊具体病因后再进行对症处理。消化道出血患者，对于不明原因粪便隐血检查阳性患者，需要通过胃镜检查方式，对消化道内部组织进行病理性观察、检测，以确诊患者损伤组织部位，并及时采取相应治疗措施。