腰椎CT和核磁共振都是检测腰椎疾病的重要影像学诊断，可用于判断腰椎间盘突出、椎管狭窄、腰椎滑脱、腰椎病变等腰椎疾病，但是腰椎CT与核磁又不相同，腰椎CT主要用于检测骨骼的成像，对骨的显像机制较好，可以清楚的发现骨骼骨质破坏或者骨受侵袭的情况。
腰椎核磁共振主要用于诊断软组织情况，相比于CT对骨的成像欠佳。腰椎核磁可以清楚的反映椎管内神经的部位和受侵犯的程度，可以判断肿瘤瘤体的大致范围以及囊肿或者病变的区域，判断软组织优于CT。