不孕不育的检查在综合性条件比较好的医院应该挂生殖科，在一般的医院也可以到妇科内分泌科进行检查。对于中西医结合医院，也可以挂妇科或者生殖科，甚至有些医院有男性生殖科，需要查男科到这些科室去检查也都可以。总体来说不孕不育是综合进行检查处理的过程，在男方要查精液，这是无创也是比较简单的检查技术。
对于女方来说检查相对复杂，对于初次的检查主要是检查子宫或者卵巢有没有肿瘤或者长囊肿等，接着会查女性的内分泌如性激素六项，甚至还有甲状腺功能，必要的时候还要照子宫输卵管碘油造影来了解输卵管通畅度等，帮助寻找不孕不育的原因，再进行针对性的处理。