咖啡色分泌物通常是阴道的一种少许血性分泌物，在阴道内存留的时间比较长，氧化以后分泌出血的颜色变深，所以分泌出来是一种咖啡色的分泌物。
咖啡色的分泌物通常有生理性的和病理性的，生理性的多表现在排卵期，在排卵期的时候，由于雌激素和孕激素水平的一过性下降，使部分子宫内膜发生剥脱引起的一个出血，通常会持续2-3天，没有任何的症状，只要休息就会自然的缓解，所以不需要治疗，是一种正常的生理现象。
病理现象包括宫颈的病变，也就是通常说的宫颈息肉、宫颈慢性的炎症和宫颈癌变。阴道的炎症导致阴道局部黏膜的溃疡、破损，有少许的分泌物。另外，就是子宫内膜炎，子宫内膜炎还有子宫内膜的恶性肿瘤，也是通常说的子宫内膜癌。除此之外，就是月经周期的改变，导致阴道流血淋漓不尽。还有一种特殊的情况，就是在服用激素类的药物，最常见的就是长效或者是短效，或者是事后的紧急避孕药，引起的一种撤退性出血。还有一个是中医服用了活血化瘀的药，有的时候在平时做艾灸等等理疗，刺激局部的血液循环，引起阴道局部的少量出血，都会有咖啡色分泌物的出现。
所以阴道的咖啡色分泌物通常有两种情况：一种是生理性的；另一种是病理性的。生理性的是正常生理现象，不需要恐慌，也不需要治疗。病理性的就需要到医院去明确病因，及时、及早的治疗。