屁股两边疼痛可由多种原因引起，具体如下：
第一、肌纤维组织炎：臀部肌肉丰富，在着凉、劳累因素影响下，可以出现肌肉的无菌性炎症，导致疼痛的情况发生。此时疼痛一般比较局限于某一部位，活动时可以使疼痛加重，予以保守治疗症状可明显缓解。
第二、腰椎间盘突出：当腰椎间盘向后突出刺激到椎管内的神经或者神经根时，可以导致神经支配的区域出现疼痛麻木的症状，而坐骨神经恰好从臀部经过，当腰椎间盘刺激坐骨神经时，也可出现臀部两边疼痛的表现。
第三、髋关节病变：例如双侧股骨头坏死时，也可刺激双侧髋部出现疼痛的表现。临床可以反映为屁股两边疼痛，需要行CT、核磁明确诊断。