阴道囊肿怎么去除，要根据囊肿的大小才可以决定。一般当阴道有比较小的囊肿，不会影响正常的生育功能，也不会影响性生活，所以这个时候可以先不给予处理，随访和观察，例如是每三个月或者半年做一次阴道镜或者妇科的检查，来判断囊肿有没有持续性的增大。
当囊肿比较大的情况下，已经影响了正常的生活和同房，这个时候尽可能还是采用激光手术的方式，帮助把囊肿拨除，然后恢复正常阴道的解剖位置，避免会造成频繁的炎症，也会影响阴道炎症的情况发生。
在切除之后一定要定期的复查，确保阴道壁是属于一个正常的情况，避免由于瘢痕组织同样也会造成性生活质量的影响。