肛门囊肿包括皮脂腺囊肿和肛周脓肿。皮脂腺囊肿大多是由于肛门周围皮脂腺局部细菌外源性入侵所导致的局部感染，时间久了以后就会导致毛囊内污染物积聚形成皮脂腺囊肿，小的皮脂腺囊肿如果平时没有任何症状，不需要特殊的治疗，只要平时注意肛门部清洁就可以。如果急性感染伴有局部积脓，需要切开引流，也可以在非急性感染发作期行手术切除。而肛周脓肿是由肛腺内感染所导致的肛管直肠周围化脓性炎症，肛周脓肿都需要行手术治疗才能够治愈，低位脓肿可以行一次性根治术，而高位的脓肿可以行挂线术或者先行切开引流，在后期形成肛瘘以后再行肛瘘手术。