全飞秒激光手术是目前眼科常用的一种微创矫正近视的手术方法，这种激光以脉冲形式运转，持续时间非常短，对周围组织形成的创伤也非常小，所以目前应用的是安全性比较高的技术，很少出现不良的并发症，但是任何手术都有可能会有风险和并发症，并不是万无一失。近视眼手术以后，常见的并发症有欠矫、过矫，也就是做完手术之后可能会剩一点近视，或者稍微有点远视。
有可能会在半年左右发生屈光回退，也就是做完手术以后又有近视了，这种有可能是角膜反应的愈合比较强烈，或者手术以后出现角膜的扩张。另外做完手术以后有可能会有干眼，就算是全飞秒手术也有点伤口，这种伤口可能会导致经过这块的神经纤维受到影响，会影响角膜的瞬目反应和泪液动力学的改变。