感冒时出现耳朵疼，通常是感染性因素而导致，在感冒时特别容易患细菌性、病毒性和真菌性感染，此时会在擤鼻涕的时候，鼻黏膜中的压力过大，会逆行感染至耳周围导致耳朵疼。感冒时出现严重的鼻窦炎，鼻窦的感染因素会逆行感染到鼓膜，导致外耳道炎和中耳道炎，也会引起耳朵疼的临床症状和表现。
感冒时身体会于释放致炎因子，例如白介-2、白介-4、白介-6、白三烯、前列腺素、缓激肽等，此类致炎因子会导致身体神经根的异常敏感，尤其在耳部神经末梢较敏感处出现疼痛。在感染时易发三叉神经炎和面神经炎的时候，也会自觉耳朵疼痛相对明显。