根尖炎的治疗包括全身的治疗和局部牙体治疗，全身治疗包括口服抗菌的药物，一般用阿莫西林或一代、二代的头孢菌素和甲硝唑片，疼痛明显的时候可以口服布洛芬胶囊或是高乌甲素片。
局部牙体治疗具有同等的重要性，在急性炎症期，可以局麻下开髓引流，清除根管内坏死的物质，根管内放置止痛的棉捻，有效缓解的疼痛。如果牙根尖区有脓液形成，应该在局麻下及时地切开引流，减轻疼痛，避免毒素的再吸收；有咬合创伤的及时调整咬合。
急性炎症控制以后，有保留价值的牙齿可以行根管治疗，没有保留价值的牙齿，应尽早地拔掉。