新型冠状病毒感染以后有可能出现后遗症。其后遗症多见于重症和危重症的患者，而对于轻症和普通的新冠肺炎，其预后相对于良好，无明显的后遗症。对于危重症的患者，因其肺组织的感染程度较为严重，肺组织可能会发现不同程度的损害。
此时，患者可能遗留有不同程度的干咳，而且咳嗽可能会持续一段时间。因肺组织发生不同程度的间质性的或纤维化样的改变，使其肺功能有不同程度下降，患者可以出现活动后的胸闷、气促，甚至低氧血症和乏力等不适。
此时，要嘱患者注意休息、氧疗，适当进行深呼吸功能锻炼等处理。因患者抵抗力有下降，此时容易受到其它的病原体感染，可能再次发生肺部感染。因患者凝血功能发生障碍，可能会诱发下肢深静脉血栓的形成，甚至导致肺栓塞的风险明显增加。